Karena sifat madu murni yang mudah menyerap air di udara, sebaiknya madu murni tidak dibiarkan disimpan dalam wadah yang tidak tertutup rapat karena kadar air dalam madu murni akan meningkat dan menyebabkan penurunan kualitas madu murni.
Botol Penyimpanan Madu Murni
Tempat penyimpanan madu murni yang disarankan adalah kemasan plastik yang food grade (lihat simbol sendok garpu di bagian bawah kemasan) atau kemasan berbahan gelas (botol kaca) yang lebih baik. Sebaiknya jangan menyimpan madu murni di dalam kemasan berbahan logam karena dapat memicu adanya reaksi kimia antara madu murni dan logam.